MolSoft ICM-Pro 3.9.4 تحلیل ساختار پروتئین و داکینگ
ICM-Pro نرمافزاری قدرتمند برای تحلیل ساختار پروتئین، مدلسازی و داکینگ است که به زیستشناسان و شیمیدانان کمک میکند تا به صورت مستقیم به پایگاههای دادهی توالی و ساختاری دسترسی داشته باشند. یابنده جیبهای ICM روشی است که محلهای اتصال لیگاند را در هر ساختار پروتئین، DNA یا RNA شناسایی میکند. محلهای اتصال پروتئین-لیگاند بر اساس نقشه پتانسیل شبکهای برهمکنشهای وندروالسی گیرنده شناسایی میشوند و سطوح کانتور میشوند. سپس خواص فیزیکی جیبها محاسبه و جدولبندی میشوند و یک امتیاز شباهت به دارو ارائه میشود. یک ماده شیمیایی را به صورت تعاملی درون یک جیب اتصال گیرنده ویرایش کنید. اتمها و گروهها را اصلاح کنید و تأثیر تغییرات بر انرژی اتصال لیگاند و امتیاز را مشاهده کنید. لیگاند را مجدداً داک کنید و به حداقل برسانید.
با استفاده از این نرمافزار میتوانید
نرم افزار یک لینک مستقیم به بانک دادههای پروتئین (PDB) دارد. پس از دانلود یک ساختار، میتوانید آن را تحلیل کنید:
- تحلیل توالی و همترازی
- بررسی ساختار پروتئین
- مطالعه جیبهای پروتئینی و لیگاندهای متصل
- ایجاد سطوح
- محاسبه الکترواستاتیک
- ایجاد جهش
- پیشبینی محلهای اتصال لیگاند
- پیشبینی محلهای برهمکنش پروتئین-پروتئین
- داکینگ مولکولهای کوچک و پروتئین-پروتئین
- طراحی لیگاند با استفاده از ویرایشگر تعاملی لیگاند
نرم افزار یک لینک مستقیم به بانک دادههای پروتئین (PDB) دارد. پس از دانلود یک ساختار، میتوانید آن را تحلیل کنید:
- ساخت نمودارهای راماچاندران
- همپوشانی چندین ساختار
- تحلیل فاصلهها و زوایا
- محاسبه نواحی تماس و سطحی
- نمایش پیوندهای هیدروژنی
- ساخت سطوح الکترواستاتیک
- محاسبه جیبهای اتصال لیگاند
در صورت تمایل به دانلود رایگان از سایت، افزونه حذف تبلبغات را غیرفعال کنید، سپس روی این قسمت کلیک کنید.
در صورتیکه از ویندوز 7 و مرورگر Internet Explorer استفاده میکنید، برای مشاهده سایت از مرورگر Edge استفاده کنید. ( 32 بیتی - 64 بیتی )
در صورتیکه از ویندوز 7 و مرورگر Internet Explorer استفاده میکنید، برای مشاهده سایت از مرورگر Edge استفاده کنید. ( 32 بیتی - 64 بیتی )
آموزش نصب و فعال سازی نرم افزار
- دسترسی به اینترنت را قطع کنید.
- فایل را از حالت فشرده خارج کنید.
- نرم افزار را نصب و اجرا کنید.
- در پنجره فعال سازی روی دکمه Browse کلیک کنید و فایل موجود در پوشه License را انتخاب کنید.
- برای جلوگیری از غیرفعال شدن کرک، نرم افزار را در فایروال آنتی ویروس یا ویندوز قرار بدید
Operation Systems
- Windows 10/11